Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Thbs3Q05895 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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