Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccl7Q03366 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms