Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pax5Q02650 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms