Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mc1rQ01727 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mc1rQ01727 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms