Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Pax8Q00288 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms