Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bmp1P98063 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms