Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SirpaP97797 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms