Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Cry1P97784 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cry1P97784 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms