Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Bop1P97452 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Bop1P97452 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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