Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkp1P97350 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pkp1P97350 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms