Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh6P97326 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh6P97326 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh6P97326 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh6P97326 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh6P97326 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh6P97326 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh6P97326 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdh6P97326 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh6P97326 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh6P97326 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh6P97326 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh6P97326 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdh6P97326 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms