Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gbx1P82976 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Gbx1P82976 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gbx1P82976 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gbx1P82976 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbx1P82976 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gbx1P82976 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gbx1P82976 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gbx1P82976 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gbx1P82976 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gbx1P82976 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbx1P82976 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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