Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Irx3P81067 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Irx3P81067 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms