Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ldb1P70662 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ldb1P70662 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms