Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxb13P70321 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms