Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp7P70280 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms