Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rpl39P62892 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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