Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snrpd1P62315 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snrpd1P62315 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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