Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga11P61622 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Itga11P61622 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Itga11P61622 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms