Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PlnP61014 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PlnP61014 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PlnP61014 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PlnP61014 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PlnP61014 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PlnP61014 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PlnP61014 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PlnP61014 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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PlnP61014 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
PlnP61014 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms