Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rin3P59729 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms