Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smpdl3bP58242 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smpdl3bP58242 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms