Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rrp1P56183 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms