Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nub1P54729 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nub1P54729 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nub1P54729 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nub1P54729 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nub1P54729 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nub1P54729 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nub1P54729 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nub1P54729 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nub1P54729 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nub1P54729 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nub1P54729 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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