Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cux1P53564 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cux1P53564 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms