Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndst2P52850 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndst2P52850 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst2P52850 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst2P52850 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst2P52850 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst2P52850 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst2P52850 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst2P52850 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst2P52850 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndst2P52850 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndst2P52850 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndst2P52850 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms