Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VdrP48281 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms