Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ItgavP43406 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ItgavP43406 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.9 ms