Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gsx2P31316 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gsx2P31316 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms