Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb1P28230 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb1P28230 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms