Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BrafP28028 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BrafP28028 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BrafP28028 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BrafP28028 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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