Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CftrP26361 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CftrP26361 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CftrP26361 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CftrP26361 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CftrP26361 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CftrP26361 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms