Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tsta3P23591 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tsta3P23591 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tsta3P23591 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tsta3P23591 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tsta3P23591 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tsta3P23591 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tsta3P23591 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tsta3P23591 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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