Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd8P23463 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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