Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PparaP23204 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PparaP23204 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PparaP23204 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PparaP23204 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PparaP23204 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PparaP23204 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PparaP23204 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PparaP23204 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PparaP23204 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PparaP23204 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PparaP23204 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PparaP23204 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms