Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pou3f1P21952 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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