Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmnb2P21619 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms