Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ntf3P20181 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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