Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a1P19437 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms