Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps6ka1P18653 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms