Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
P18528 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18528 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18528 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18528 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18528 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
P18528 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
P18528 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P18528 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms