Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp54P14576 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Srp54P14576 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Srp54P14576 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Srp54P14576 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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