Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt8P11679 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt8P11679 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms