Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DmdP11531 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DmdP11531 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
DmdP11531 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
DmdP11531 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
DmdP11531 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DmdP11531 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DmdP11531 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DmdP11531 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DmdP11531 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DmdP11531 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
DmdP11531 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DmdP11531 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
DmdP11531 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
DmdP11531 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
DmdP11531 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
DmdP11531 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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DmdP11531 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
DmdP11531 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
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