Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
TtrP07309 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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TtrP07309 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TtrP07309 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TtrP07309 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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