Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Tgfb1P04202 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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