Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt10P02535 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt10P02535 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt10P02535 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt10P02535 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt10P02535 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt10P02535 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt10P02535 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt10P02535 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt10P02535 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt10P02535 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt10P02535 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt10P02535 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms