Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
P01786 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
P01786 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
P01786 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms