Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01647 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01647 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01647 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01647 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01647 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01647 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01647 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01647 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01647 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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