Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CcnkO88874 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CcnkO88874 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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